Отчего такое бывает — хз, у меня тормоза появились после миграции с одного мака на другой, в Adium & Twitter & Skype.
Как лечить? Вот так:
sudo rm /Library/Preferences/com.skype.skype.plist
rm ~/Library/Preferences/com.skype.skype.plist
rm -rf ~/Library/Caches/com.skype.skype/Меняем скайп на название тормозящей программы и всё ОК!